CHRONECT® Workstation Proteomics

CHRONECT® Workstation Proteomics è la piattaforma di preparazione automatizzata dei campioni per i laboratori di proteomica.

Brand: Axel Semrau Categoria: Soluzioni di automazione Tag: chromatografy workstation, CHRONECT® Workstation Proteomics, stazioni per la cromatografia

Descrizione

CHRONECT® Workstation Proteomics è la piattaforma di preparazione automatizzata dei campioni per i laboratori di proteomica in grado di ottimizzare la produttività e ridurre al minimo gli errori di manipolazione.

Spettrometria di massa

L’identificazione spettrometrica di massa e la quantificazione richiedono una suddivisione preventiva delle proteine in peptidi. Questa scissione, nota anche come digestione proteica, richiede enzimi di restrizione come la tripsina proteasi o l’endopeptidasi Lys-C.

L’analisi mediante metodi spettrometrici di massa può essere elaborata utilizzando proteine in soluzione o proteine purificate da SDS-PAGE.

Le fasi di preparazione del campione

La preparazione del campione è divisa in più fasi. Il primo passo dopo la denaturazione e il lavaggio del campione è una riduzione e successiva alchilazione del gruppo solfidrile all’interno delle proteine. Pertanto, vengono utilizzati i reagenti TCEP e CAA. Successivamente, viene eseguita la digestione enzimatica effettiva e vengono estratti i peptidi appena emersi. Questi ultimi vengono quindi analizzati mediante spettrometria di massa.

Accuratezza e riproducibilità con CHRONECT® Workstation Proteomics

Per la generazione di solidi dati proteomici, è necessaria una procedura riproducibile. Pertanto, si consiglia l’ultimazione di una preparazione automatizzata del campione.

In collaborazione con Axel Semrau®, il Max-Delbrück-Centrum per la medicina molecolare, ha sviluppato un metodo standard automatizzato per la digestione delle proteine. Il metodo è stato trasferito alla robotica campione RTC PAL in collaborazione con istituti di ricerca affermati.

Il software CHRONOS® viene utilizzato per controllare l’intero sistema, per un utilizzo ottimizzato del tempo e consentire un throughput più elevato.

Automazione del processo

Seguono le fasi di automazione del processo di digestione delle proteine all’interno della soluzione:

Inserire il campione di proteine nel buffer
Aggiungere TCEP per condurre una riduzione (30 min)
Alchilato di CAA (20 min)
Aggiungere Lys-C per il primo digest (3 h)
Diluire il campione con tampone
Aggiungere tripsina per il secondo digest (10 h)
Completare la digestione da parte di TFA

La piattaforma CHRONECT® Proteomics include un vassoio speciale collegato alla pompa del vuoto, che consente la digestione delle proteine direttamente all’interno del gel per elettroforesi.

Digestione proteica

Digestione proteica all’interno del gel per elettroforesi (In-Gel Digest), le fasi:

Inviare la sezione gel nel vassoio con la stazione del vuoto
Lavare accuratamente il gel
Aggiungere TCEP per condurre una riduzione (30 min)
Alchilato di CAA (20 min)
Aggiungere tripsina per il digest (10 h)
Completare la digestione da parte di TFA

Le soluzioni applicative di Axel Semrau® saranno preinstallate e testate presso il laboratorio applicativo e consegnate completamente funzionali all’utente. Ciò garantisce l’applicazione più rapida possibile per la base di misurazione di routine.

Benefici

CHRONECT® Workstation Proteomics offre diversi benefici ai laboratori in termini di:

ottimizzazione dei flussi di lavoro
accuratezza e riproducibilità dei risultati, non vi è rischio di contaminazione
sicurezza del processo, le attività manuali pericolose vengono trasferite all’applicazione e sono completamente tracciabili,
massimizzazione della produttività, con l’automazione dei processi si ha un’ottimizzazione dei tempi di lavoro e una riduzione degli errori